Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

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Length 770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pou2f1P25425 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou2f1P25425 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou2f1P25425 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou2f1P25425 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou2f1P25425 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou2f1P25425 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou2f1P25425 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou2f1P25425 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou2f1P25425 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou2f1P25425 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou2f1P25425 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou2f1P25425 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou2f1P25425 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms