Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PparaP23204 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PparaP23204 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PparaP23204 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PparaP23204 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PparaP23204 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PparaP23204 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PparaP23204 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PparaP23204 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PparaP23204 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PparaP23204 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PparaP23204 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PparaP23204 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PparaP23204 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PparaP23204 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PparaP23204 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PparaP23204 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PparaP23204 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PparaP23204 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PparaP23204 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PparaP23204 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PparaP23204 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PparaP23204 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms