Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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