Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TP20293 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TP20293 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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TP20293 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TP20293 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms