Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ntf3P20181 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ntf3P20181 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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