Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NefhP19246 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NefhP19246 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NefhP19246 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NefhP19246 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NefhP19246 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NefhP19246 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NefhP19246 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NefhP19246 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NefhP19246 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NefhP19246 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NefhP19246 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NefhP19246 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NefhP19246 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NefhP19246 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NefhP19246 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NefhP19246 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NefhP19246 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NefhP19246 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NefhP19246 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NefhP19246 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NefhP19246 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NefhP19246 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NefhP19246 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NefhP19246 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NefhP19246 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NefhP19246 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NefhP19246 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NefhP19246 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NefhP19246 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NefhP19246 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NefhP19246 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NefhP19246 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NefhP19246 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NefhP19246 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NefhP19246 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NefhP19246 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NefhP19246 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NefhP19246 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NefhP19246 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NefhP19246 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NefhP19246 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NefhP19246 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NefhP19246 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NefhP19246 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NefhP19246 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NefhP19246 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NefhP19246 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NefhP19246 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NefhP19246 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NefhP19246 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NefhP19246 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NefhP19246 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NefhP19246 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NefhP19246 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NefhP19246 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NefhP19246 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NefhP19246 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms