Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18530 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18530 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18530 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P18530 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18530 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18530 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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