Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tgfb3P17125 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms