Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Srp54P14576 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Srp54P14576 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp54P14576 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp54P14576 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Srp54P14576 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Srp54P14576 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Srp54P14576 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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Srp54P14576 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Srp54P14576 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Srp54P14576 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Srp54P14576 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp54P14576 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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