Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms