Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms