Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PolP11369 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PolP11369 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PolP11369 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PolP11369 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PolP11369 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PolP11369 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PolP11369 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PolP11369 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PolP11369 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PolP11369 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PolP11369 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PolP11369 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms