Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Tnp1P10856 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms