Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Surf1P09925 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms