Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb1P09055 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms