Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

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Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NefmP08553 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefmP08553 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefmP08553 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefmP08553 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NefmP08553 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefmP08553 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NefmP08553 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefmP08553 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefmP08553 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefmP08553 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefmP08553 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefmP08553 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefmP08553 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefmP08553 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefmP08553 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NefmP08553 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefmP08553 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefmP08553 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefmP08553 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefmP08553 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NefmP08553 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefmP08553 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefmP08553 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefmP08553 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefmP08553 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefmP08553 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefmP08553 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefmP08553 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefmP08553 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefmP08553 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NefmP08553 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefmP08553 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefmP08553 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefmP08553 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefmP08553 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefmP08553 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefmP08553 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefmP08553 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefmP08553 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefmP08553 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefmP08553 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefmP08553 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefmP08553 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefmP08553 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefmP08553 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefmP08553 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefmP08553 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NefmP08553 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefmP08553 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefmP08553 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefmP08553 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefmP08553 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefmP08553 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefmP08553 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefmP08553 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefmP08553 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefmP08553 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefmP08553 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefmP08553 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefmP08553 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefmP08553 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefmP08553 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NefmP08553 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NefmP08553 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NefmP08553 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NefmP08553 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NefmP08553 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NefmP08553 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NefmP08553 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NefmP08553 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NefmP08553 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NefmP08553 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NefmP08553 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NefmP08553 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NefmP08553 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NefmP08553 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NefmP08553 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NefmP08553 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NefmP08553 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NefmP08553 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NefmP08553 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NefmP08553 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NefmP08553 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NefmP08553 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NefmP08553 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NefmP08553 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NefmP08553 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NefmP08553 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NefmP08553 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NefmP08553 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NefmP08553 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NefmP08553 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NefmP08553 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NefmP08553 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NefmP08553 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NefmP08553 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NefmP08553 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NefmP08553 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NefmP08553 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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