Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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