Protein–RNA interactions for Protein: P04756

Chrna1, Acetylcholine receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna1P04756 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrna1P04756 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna1P04756 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms