Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04214 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04214 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04214 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04214 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04214 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04214 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04214 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04214 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04214 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04214 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04214 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04214 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04214 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04214 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04214 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04214 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04214 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms