Protein–RNA interactions for Protein: P01898

H2-Q10, H-2 class I histocompatibility antigen, Q10 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q10P01898 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q10P01898 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms