Protein–RNA interactions for Protein: P01843

Ig lambda-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01843 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01843 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01843 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01843 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01843 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01843 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01843 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01843 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01843 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms