Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01648 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01648 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01648 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01648 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01648 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01648 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01648 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01648 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01648 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01648 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01648 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01648 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01648 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01648 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01648 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01648 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01648 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01648 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01648 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01648 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01648 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01648 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01648 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01648 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01648 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01648 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01648 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01648 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01648 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01648 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01648 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01648 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01648 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01648 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01648 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01648 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01648 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01648 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01648 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01648 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01648 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01648 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01648 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01648 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01648 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01648 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01648 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01648 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01648 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01648 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01648 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01648 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01648 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01648 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01648 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01648 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01648 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01648 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01648 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01648 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01648 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01648 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01648 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01648 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms