Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01644 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01644 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01644 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01644 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01644 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01644 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01644 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01644 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01644 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01644 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01644 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01644 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01644 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01644 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01644 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01644 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01644 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01644 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01644 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01644 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01644 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01644 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01644 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01644 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01644 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01644 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01644 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01644 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01644 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01644 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01644 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01644 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01644 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01644 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01644 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01644 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01644 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01644 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01644 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01644 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P01644 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P01644 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01644 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01644 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01644 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01644 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01644 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01644 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms