Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casp8O89110 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp8O89110 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp8O89110 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Casp8O89110 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.3 ms