Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BlmO88700 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BlmO88700 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BlmO88700 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BlmO88700 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BlmO88700 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BlmO88700 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BlmO88700 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BlmO88700 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BlmO88700 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BlmO88700 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BlmO88700 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BlmO88700 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BlmO88700 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BlmO88700 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BlmO88700 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BlmO88700 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BlmO88700 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BlmO88700 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BlmO88700 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BlmO88700 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BlmO88700 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BlmO88700 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BlmO88700 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BlmO88700 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BlmO88700 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BlmO88700 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BlmO88700 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BlmO88700 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BlmO88700 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BlmO88700 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BlmO88700 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BlmO88700 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BlmO88700 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BlmO88700 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BlmO88700 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BlmO88700 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BlmO88700 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BlmO88700 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BlmO88700 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BlmO88700 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BlmO88700 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BlmO88700 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BlmO88700 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BlmO88700 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BlmO88700 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BlmO88700 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BlmO88700 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BlmO88700 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BlmO88700 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BlmO88700 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BlmO88700 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BlmO88700 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BlmO88700 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BlmO88700 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BlmO88700 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BlmO88700 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BlmO88700 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BlmO88700 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BlmO88700 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BlmO88700 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BlmO88700 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BlmO88700 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BlmO88700 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms