Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb5O70309 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms