Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lnx1O70263 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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