Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cbx4O55187 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cbx4O55187 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cbx4O55187 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cbx4O55187 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cbx4O55187 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cbx4O55187 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cbx4O55187 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cbx4O55187 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cbx4O55187 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cbx4O55187 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cbx4O55187 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cbx4O55187 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cbx4O55187 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cbx4O55187 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cbx4O55187 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cbx4O55187 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cbx4O55187 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cbx4O55187 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cbx4O55187 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cbx4O55187 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cbx4O55187 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cbx4O55187 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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