Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja1O55176 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja1O55176 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja1O55176 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja1O55176 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms