Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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BckdkO55028 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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BckdkO55028 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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BckdkO55028 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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BckdkO55028 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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BckdkO55028 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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BckdkO55028 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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BckdkO55028 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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