Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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Dnajb6O54946 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Dnajb6O54946 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajb6O54946 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms