Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn5O54942 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms