Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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