Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CrxO54751 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CrxO54751 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CrxO54751 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CrxO54751 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CrxO54751 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CrxO54751 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CrxO54751 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CrxO54751 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CrxO54751 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CrxO54751 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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CrxO54751 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CrxO54751 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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