Protein–RNA interactions for Protein: O35900

Lsm2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm2O35900 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm2O35900 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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