Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms