Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf18O35714 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms