Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms