Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2f3O35261 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
E2f3O35261 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2f3O35261 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms