Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx3O35160 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms