Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms