Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Scarb2O35114 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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