Protein–RNA interactions for Protein: O19442

H2-M9, Histocompatibility 2, M region locus 9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M9O19442 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H2-M9O19442 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H2-M9O19442 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H2-M9O19442 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H2-M9O19442 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H2-M9O19442 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H2-M9O19442 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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H2-M9O19442 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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H2-M9O19442 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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H2-M9O19442 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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H2-M9O19442 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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H2-M9O19442 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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H2-M9O19442 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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H2-M9O19442 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-M9O19442 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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H2-M9O19442 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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