Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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H2-Q1O19441 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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H2-Q1O19441 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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H2-Q1O19441 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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H2-Q1O19441 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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H2-Q1O19441 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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H2-Q1O19441 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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H2-Q1O19441 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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H2-Q1O19441 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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H2-Q1O19441 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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H2-Q1O19441 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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