Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3aO08665 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms