Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf6O08584 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf6O08584 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf6O08584 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf6O08584 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf6O08584 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf6O08584 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf6O08584 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms