Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec22bO08547 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms