Protein–RNA interactions for Protein: L7N479

Tcrg-C3, T cell receptor gamma, constant 3, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-C3L7N479 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tcrg-C3L7N479 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tcrg-C3L7N479 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tcrg-C3L7N479 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tcrg-C3L7N479 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tcrg-C3L7N479 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Tcrg-C3L7N479 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tcrg-C3L7N479 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tcrg-C3L7N479 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tcrg-C3L7N479 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tcrg-C3L7N479 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tcrg-C3L7N479 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Tcrg-C3L7N479 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tcrg-C3L7N479 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Tcrg-C3L7N479 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Tcrg-C3L7N479 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Tcrg-C3L7N479 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Tcrg-C3L7N479 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Tcrg-C3L7N479 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Tcrg-C3L7N479 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tcrg-C3L7N479 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tcrg-C3L7N479 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tcrg-C3L7N479 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tcrg-C3L7N479 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tcrg-C3L7N479 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tcrg-C3L7N479 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Tcrg-C3L7N479 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tcrg-C3L7N479 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tcrg-C3L7N479 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tcrg-C3L7N479 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tcrg-C3L7N479 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tcrg-C3L7N479 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tcrg-C3L7N479 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Tcrg-C3L7N479 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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