Protein–RNA interactions for Protein: K7N6T7

Gm2897, Predicted gene 2897, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2897K7N6T7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2897K7N6T7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2897K7N6T7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2897K7N6T7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2897K7N6T7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2897K7N6T7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2897K7N6T7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2897K7N6T7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2897K7N6T7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2897K7N6T7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2897K7N6T7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2897K7N6T7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2897K7N6T7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2897K7N6T7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2897K7N6T7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2897K7N6T7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms