Protein–RNA interactions for Protein: J3QNG1

Gm6408, Predicted gene 6408, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6408J3QNG1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6408J3QNG1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6408J3QNG1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6408J3QNG1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6408J3QNG1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6408J3QNG1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6408J3QNG1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6408J3QNG1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6408J3QNG1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6408J3QNG1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6408J3QNG1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6408J3QNG1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6408J3QNG1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6408J3QNG1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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